对灌木，水洼等适合蚊虫繁殖的环境进行火攻，土埋等方式清理干净。
大型水域，投放一些蚊子幼虫的天敌鱼类控制其种族规模。
在东非殖民地，疟疾等疾病就和抽奖一样，抽取移民中倒霉的人，好在这个时代奎宁已经出现。
恩斯特还特意从南美引入了金鸡纳霜树的树种在东非合适的地方栽培，同时还有各种中草药，
西药目前还比较玄学，没有彻底成熟，放血疗法还是当代医生的主流治疗手法，仅在1833年，法国仍然进口了四千多万只水蛭。
好在现在越来越多的学者开始质疑反对传统西医的理论，恩斯特正处在传统西医向现代医学过渡的时代。
19世纪是西药进入到飞速发展时代。1816年默克（美国）、1849年辉瑞（美国）、1859年诺华（瑞士）、1863年拜耳（德国）、1873年葛兰素（英国）、1875年史克（英国）、1888年雅培（美国）、1896年罗氏（瑞士）等西药公司纷纷成立，人类进入西药时代。
不可否认，在当前的一些欧美医学实验室里，可能在迸发着无数医学智慧的结晶，并会在未来几十年里彻底取代传统医学的地位。
但这个过程是漫长的，一直要持续到20世纪，现代医学的大厦才能彻底建立。
前沿医学虽然突飞猛进，但是当前时代的主流临床医学还是那些传统的“老西医”操手。
这些尚未淘汰的“老西医”对疾病，细菌和病毒的认知还停留在上个时代，手术没有麻醉，止血和消毒的概念。所以经常会有比较离谱的医学事故发生。
恩斯特可不敢和他们赌手气，所以还是那些经验成熟且副作用小的药方更让人安心。
除了从东非本土土著手中获得一些当地人的草药外，还从中医和西医里寻找一些成熟可靠的药物。
比如金鸡纳霜，青蒿，等对疟疾有效的药物，恩斯特不是医学生，不懂这些药物如何处理。
可有药在手总比没药要强，如果殖民地移民不幸得了疟疾。
就只能用这两样熬水喝了，倒不是不想用提取的药剂，而是成本太高，殖民地那么大，人口也不少，各方面开支不小，而种植药物除了人力成本外，几乎没有额外成本。
土地都是现成，只要环境适合，想种多少就种多少，而从欧洲订购药物价格就高了。
眼下，东非殖民地对传染病的防治最有效的手段还是隔离，一但发现问题，就单独隔离起来。
免疫力好挺过来，挺不过来就只能痛苦去世了。
恩斯特当然也采购了一些药物，但是因为交通的原因，大部分药物都在距离海港最近的上滨海区。
内陆在物资和药物补给方面比较滞后，所以这就要求内陆的殖民据点比上滨海区发挥更大的主观能动性。
多组织移民开展卫生清洁活动，集中规划管理垃圾和排泄物，消灭蚊虫的栖息地，种植驱蚊植物（东非是除虫菊产地）……
最大限度的预防传染疾病的传播，在当前时代，可以说东非殖民地移民对卫生的概念世界领先。
他们或许不知道卫生是什么，但是他们知道长官要求自己不要随手乱丢垃圾，乱吃食物，随地大小便……
这些都是殖民地管理层强制执行的，不然违规的人会受到严厉的处罚。
殖民地管理层其实也没有太多卫生观念，但是恩斯特强制殖民地按照他的指示实行，而且恩斯特大义禀然的对殖民地管理层说，这些都是欧洲专家们得出的结论。
不管殖民地官员信不信，在照恩斯特的话做了以后，东非殖民地的疾病确实控制在一个低水平范围之内。
和其他国家的殖民地对比，效果显著，甚至比一些开发成熟的地区和国家还要好，比如隔壁的莫桑比克和南亚的印度。